A partire dal XIII secolo , somali e pastori nomadi stabilitosi nel nord del Corno d'Africa , cominciarono a emigrare in direzione dell'attuale regione della Somalia. Prima i Galla , pastori e agricoltori , avevano iniziato la loro migrazione dall' Ogaden e l' Abissinia . Tutti questi popoli si installarono definitivamente sul territorio. Alcuni popoli arabi provarono ad appropriarsi del territorio, fra questi i sultani di Zanzibar che giunsero ad impadronirsi delle coste. Molti somali si dispersero nel territorio, specialmente in prossimità dell' Abissinia .

L'anno 1884 pose fine a un lungo periodo di pace. Con la Conferenza di Berlino , iniziò una lungo lotta sanguinosa in cui tre stati si contendevano la Somalia. L' Italia , la Gran Bretagna e la Francia si spartirono il suo territorio nel tardo XIX secolo .

I britannici stabilirono il Protettorato della Somalia Britannica nel 1886 dopo la ritirata dell'Egitto e il trattato con il clan Warsangeli. L' Egitto tentava di impedire l'espansione coloniale europea nell'Africa nordorientale. L'area meridionale, occupata dall'Italia nel 1892 , divennero conosciuti come Somalia Italiana . La parte più settentrionale del territorio fu data alla Francia, che stabilì la Somalia Francese , costituita dai territori di Afars e Issas.

La Guerra somala per la Resistenza Coloniale ( 1898 - 1920 ) fu guidata dal poeta, scolaro e politico somalo Mohammed Abdullah Hassan . La guerra terminò con il bombardamento da parte della RAF del forte di Sayid , che causò una grande perdita di militari e civili somali.

L'indipendenza delle colonie fu ottenuta nel 1960 : Somalia Italiana e Somalia Britannica divennero parte dell'attuale stato unendosi subito. Lo stato del Gibuti , l'ex Somalia Francese, divenne indipendente nel 1977 .

Dal 1960 al 1969: la guerra con L'Etiopia

Nel 1964 e nel 1977 la Somalia combatte due guerre contro l' Etiopia (governata da cristiani ). Le guerre non erano tuttavia di matrice religiosa, ma territoriale. Era infatti conteso il territorio che era popolato da somali ma rimasto all'Etiopia in seguito alla divisione delle terre colonizzate effettuata dalla Gran Bretagna nella seconda metà dell'Ottocento. Il territorio di Ogaden è rimasto poi all'Etiopia ed il governo somalo ha successivamente deciso di abbandonarne la rivendicazione.

Dal 1969 al 1991: la dittatura di Siad Barre

Nel 1969 , un colpo di stato militare portò al potere il generale Siad Barre . Fra la fine degli anni '70 e l'inizio degli anni '80 iniziarono a formarsi organizzazioni di guerriglia ostili al regime di Barre. Ebbe così inizio un'epoca di guerra civile intermittente che, sebbene con diversi contendenti, perdura ancora oggi. Nel 1991 Barre fu estromesso; la lotta per il potere che ne seguì contrappose diversi gruppi tribali, in un nuovo crescendo di violenza accompagnato peraltro da una terribile carestia . Nello stesso anno, l'ex Somaliland annunciò la propria secessione , un evento che diede origine a nuovi scontri.

Dal 1991 al 2004: il caos ed il fallimento della missione ONU

Il conflitto divenne sempre più confuso e violento, culminando nella Battaglia di Mogadiscio , che aumentò l'ostilità della popolazione locale. Gli americani si ritirarono nei primi mesi del 1994, provocando il fallimento della missione UNOSOM. Nel 1995 l' ONU , incapace di far fronte alla situazione, ritirò le proprie forze (nella missione "Restore Hope", partecipava anche l'Italia). Il periodo fu caratterizzato dalle violenze dei " Signori della guerra ", i temibili capi-clan che sottomisero la popolazione e che costrinsero alla fuga, nel 1994, anche i caschi blu dell'ONU e i marine americani. Essi imperversarono per anni in gran parte del sud del Paese (la zona fertile ed agricola della Somalia).

Verso la fine degli anni '90 ci fu un momento di scambi diplomatici importante, che incluse un accordo fra ventisei fazioni ( 1997 ), la Conferenza di pace di Gibuti ( 2000 ), e la Conferenza di pace di Mbagathi ( 2002 ).

Dal 2004 al 2006: il governo di transizione, le Corti Islamiche e l'intervento dell'Etiopia

Nel 2004 il processo di pacificazione sembrava avviarsi alla conclusione; fu eletto dalla IGAD (l'organizzazione politico-commerciale formata dai paesi del Corno d'Africa) un parlamento federale e furono nominati un presidente ad interim ( Abdullah Yusuf ) e un governo, il Governo Federale di Transizione somalo (Tfg) (con Primo Ministro Mohamed Geddi ). Queste deboli istituzioni tuttavia non riuscirono a rendere effettivo il loro potere e a governare davvero il paese, anche a causa dell'opposizione dei "signori della guerra" di Mogadiscio, quasi tutti componenti del governo stesso.

Infatti il ne il Parlamento, tanto meno il Governo è stato eletto, bensi uscito da una trattativa durata due anni in Kenya tra i vari signori della guerra. Era la 14° conferenza di "pace" in cui, per esigenza di Ordine Nuovo, sono intervenuti sia gli USA, direttamente e tramite Etiopia, e UE.

Proprio per questa non trascurabile presenza i vari signori si sono accordati di creare una parvenza di governo e Mr. Yusuf, il più potente signore della guerra, nominato come Presidente. In ogni caso, aldilà della facciata concorde, nessun signore della guerra era disposto a lasciare il proprio feudo e consegnarlo ad un'altro signore con cui era in guerra da 16 anni. -- Hussein Aden 13:42, 26 dic 2007 (CET)

Nel febbraio del 2006 , dopo 16 aani di guerra tra di loro, improvvisamente e stranamente i "signori della guerra" iniziarono una guerra contro Al qaeda , attaccando alcuni integralisti islamici nella capitale. La popolazione fu incapace di fermarli, e furono colpiti molti islamici integralisti inoffensivi (autorità religiose o persone molto legate all'islam) colpevoli solo di essere presunti affiliati ad Al qaeda. La stessa popolazione si schierò a favore degli integralisti colpiti.

Una nuova crisi giunse nell'estate del 2006 ; le milizie controllate dalle Corti islamiche (sostenute, secondo l'ONU, da Iran , Libia e Arabia Saudita ) scacciarono da Mogadiscio, con l'appoggio della popolazione civile, i signori della guerra e presero il controllo della parte centro-meridionale del Paese. Per contrastare la loro avanzata e impedire il rovesciamento del governo provvisorio somalo internazionalmente riconosciuto, l'esercito etiope entrò in soccorso dell'esercito governativo somalo, sostenuto anche da Uganda , Yemen e Kenya . Il governo provvisorio si rifugiò a Baidoa (a circa 250 chilometri da Mogadiscio), perdendo il controllo della capitale.

Per ben due volte si tentò, vanamente, di trovare un accordo tra Corti islamiche e governo provvisorio, sotto la mediazione di IGAD , Lega araba e ONU . Il governo transitorio ha sempre avuto l'appoggio dell'Etiopia, allo scopo di essere difeso dagli eventuali attacchi della Unione delle Corti islamiche.

Il 14 agosto 2006 Galmudug si auto-dichiarò uno Stato all'interno della Somalia.

Nella seconda metà del 2006 le Corti islamiche riuscirono a riportare una relativa pace nelle città e nelle regioni che governavano (Mogadiscio compresa): scesero i prezzi di molti beni di prima necessità, e riaprirono perfino, dopo undici anni, il porto e l'aeroporto. Ma tutto questo venne ottenuto grazie a esecuzioni sommarie e a gravi riduzioni delle libertà (come la chiusura dei cinema).

Il governo transitorio stabilì poi un'alleanza con l'amministrazione autonoma del Puntland , allo scopo di contrastare l'avanzata delle milizie delle Corti islamiche verso le città di Baidoa e Galcayo . Le milizie dell'Unione costituirono una minaccia per la Repubblica autonoma del nord-ovest e per lo stesso Puntland (regioni non riconosciute dalla comunità internazionale, e tuttavia rispettate in Somalia, grazie ai loro governi stabili). Tali territori avevano inoltre infrastrutture pienamente operative (tra cui porti e aeroporti).

Così, nel dicembre 2006 il Consiglio di Sicurezza dell' ONU approvò la risoluzione 1725, che diede il via libera formale (revocando l'embargo delle armi al governo federale) a una forza internazionale regionale con il compito di “monitorare e mantenere la sicurezza a Baidoa”, permettendo di fatto alle istituzioni transitorie di riarmarsi. Pochi giorni dopo si riacutizzarono gli scontri tra le milizie delle Corti islamiche e le truppe fedeli al governo provvisorio di Baidoa (sostenute militarmente dall' Etiopia ). Sul finire dello stesso mese, le truppe etiopi, intervenute pesantemente a sostegno del governo di Baidoa, entrarono nella capitale somala dopo pochi ma violentissimi giorni di guerra, provocando migliaia di morti e suscitando la ferma disapprovazione di Unione Africana , Lega Araba ed IGAD .

Dal 2007 ad oggi: la tragedia umanitaria

Il 9 gennaio 2007 gli Stati Uniti entrarono militarmente nel conflitto, a supporto dell'esercito etiope e con il sostegno del presidente e del governo somalo, causando la morte di numerosi civili ricevendo dure critiche dall' Unione Europea e dall' ONU . Sono stati colpiti numerosi villaggi nel sud del paese, in cui (secondo i militari americani), si sarebbero rifugiati esponenti di Al qaeda. Pochi giorni dopo, i signori della guerra (tra cui Mohamed Qanyare Afrah, del clan dei murursade , e Mussa Sudi Yalaow, a capo degli Abgal/daud ) accettarono di disarmare le loro milizie e di entrare nel nuovo esercito nazionale. Nello stesso periodo, il parlamento sfiduciò il suo portavoce (Sharif Hassan Shek Aden), ritenuto troppo vicino alle Corti Islamiche.

Nei primi giorni del mese di marzo, sono giunte a Mogadiscio le truppe ugandesi della missione di pace dell'Unione africana (Amisom, African Mission to Somalia) incaricate dall' Unione Africana di controllare la capitale e contrastare il ritorno delle milizie islamiche. Nonostante fosse atteso per i mesi successivi l'arrivo nel Paese del resto dei "caschi verdi" (con truppe provenienti da Nigeria , Ghana , Malawi e Burundi ), il solo contingente ugandese è rimasto per tutto il 2007 in territorio somalo.

Nonostante l'arrivo delle truppe ugandesi, gli scontri sono aumentati di intensità (anche contro gli stessi "caschi verdi"). La situazione a Mogadiscio è precipitata nel caos come non accadeva da anni, con il perdurare di violenti scontri tra truppe etiopi, governo di transizione e nuovamente i signori della guerra da un lato e milizie islamiche dall'altro.

Nel maggio 2007, l' ONU ha annunciato che il governo somalo ha accettato di nominare la commissione di inchiesta che indagherà sui crimini dei guerra commessi nel corso degli scontri del mese di aprile tra le truppe governative appoggiate dall'esercito etiope ed i ribelli appoggiati da miliziani delle Corti islamiche.

Alla fine di luglio 2007, il lieve miglioramento della situazione ha consentito il rientro di 125.000 sfollati. Tuttavia, i combattimenti non sono cessati, e la Conferenza di Pace e Riconciliazione pare non avere alcun effetto. Ancora da risolvere è la questione del Somaliland , stato autoproclamatosi indipendente.

Nell'autunno del 2007 la situazione è drammaticamente precipitata. A Mogadiscio (in preda a caos, violenze ed epidemie) si è in piena catastrofe umanitaria, e gli sfollati hanno raggiunto quota un milione nel solo anno in corso. Le truppe etiopi continuano a imperversare ed a scontrarsi con i ribelli armati, mentre il contingente militare ugandese appare incapace di opporre la minima resistenza.

Nel gennaio 2008 il nuovo primo ministro Nur Hassan Hussein , eletto a novembre 2007, è giunto per la prima volta a Mogadiscio. Sempre nel gennaio 2008, sono giunti in Somalia 440 soldati del Burundi a rafforzare il contingente di pace dell'Unione Africana.